Il sistema Metasys fornisce preferenze personalizzate per l’interfaccia utente di Metasys. Le preferenze consentono di configurare il comportamento delle interfacce utente, compresi effetti sonori e colori, viste di avvio, priorità di allarme e collegamenti dall'interno delle interfacce utente alle applicazioni esterne. Le preferenze sono suddivise in due categorie: preferenze di sistema e preferenze dell'utente. Le preferenze di sistema si applicano a tutti gli utenti che si collegano al sito o al dispositivo e influenzano le prestazioni e il funzionamento del sistema. Le preferenze dell'utente si applicano ad uno specifico utente del sistema Metasys e definiscono il modo in cui le informazioni vengono visualizzate nelle interfacce utente. Le preferenze dell'utente non influiscono sul funzionamento del sistema.